諧波對公用電網和其他系統的危害主要有以下幾個方面：
- 使公用電網中的元件產生了附加的諧波損耗。降低發電、輸電及用電設備的效率，大量3次諧波電流流過中線時會使線路過熱其至發生火災；
- 諧波影響各種電氣設備的正常工作。如諧波對電機的影響除引起附加損耗外，還會產生機械振動、噪聲和過電壓等；
- 諧波會引起電網中局部的并聯諧振和串聯諧振，從而使諧波放大；
- 諧波會導致繼電保護裝置的誤動，并會使電氣儀表計量不準確。
- 會對臨近的通訊系統產生干擾。
根據我們的工程經驗，對電力用戶來講，諧波最直接的影響有：
- 造成無功補償電容器（TSC）無法投運，或者電容器（或其熔斷器）燒毀；
- 干擾設備運行，比如在大慶油田某轉油站曾發生諧波導致加藥泵運轉不平穩（工人稱之為“咳嗽”）；在安陽鋼鐵廠曾發生諧波導致PLC頻繁跳機；
- 造成數控機床、PLC等控制系統的控制模塊或家用及辦公電器莫名其妙損壞，比如在湖北某軍工廠發生因諧波導致數控機床控制模塊不定期損壞，在天津靜海區發生諧波導致附近村莊的家用電器損壞等；
- 造成變壓器不過載情況下過熱或響聲過大，電纜過熱等等。
在諧波治理的效益評價方面，目前最大的困難是，除上述4點外，諧波的危害和諧波治理所能帶來的經濟效益更多的時候都是潛在的，或者說難以量化而只能感性表述。但這并不意味著諧波的危害不嚴重。做個類比，空氣污染、水污染等環境污染，并不是說會立即導致人生病甚至死亡，即便從長期看，也不會導致所有的人都生病或者死亡，但它的威脅一直存在，它的危害足以抵消經濟發展所帶來的好處。諧波對電網就像環境污染對人一樣，屬于“慢性毒藥”。
目前我國對電力諧波的相關限制主要依據如下三個國家標準：
- GB/T 14549-93 《電能質量 公用電網諧波》
- GB/Z 17625.6-2003 《電磁兼容 限值 對額定電流大于16A的設備在低壓供電系統中產生的諧波電流的限制》
- GB 17625.1-2003 《電磁兼容 限值 諧波電流發射限值（設備每相輸入電流≤16A）》
